Por defecto Thunderbird abre los enlaces con Firefox aun teniendo como navegador por defecto (en el sistema) otro, en este caso Google Chrome.
Una solución sería en Thunderbird ir a Editar->Preferencias->Adjuntos y en la «lista» modificar el navegador con los que se abrirán los enlaces, es posible que esta lista se encuentre vacía por tanto esta solución no lleva a nada.
Otra solución es editar el archivo ~/.local/share/applications/mimeapps.list, en consola:
nano ~/.local/share/applications/mimeapps.list
Buscar la línea:
x-scheme-handler/http=firefox.desktop
Y cambiarlo por:
x-scheme-handler/http=chrome.desktop
iloo 